药学系始建于2002年，是一个拥有多层次药学专门人才培养模式，集教学、科研、社会服务为一体的教育机构。目前在校生700余人。现有药学和中药学两个本科专业。药学专业是山西省特色专业、山西省优势特色专业建设项目及山西省本科一流专业建设点，药学一级学科是山西省重点扶持学科，药学综合实验教学中心是山西省综合实验教学示范中心，药理学教学团队是山西省优秀教学团队，药理学课程是山西省精品资源共享课，药理学及基础化学两门课程是山西省高等学校精品共享线上培育课程，药学系集体荣获山西省三八红旗集体奖及工人先锋号等荣誉称号。中药学专业是体现地方中医药特色而设立的一个新专业。
药学系设有化学、药理学、药剂学、药物化学、药物分析、中药资源与鉴定、临床中药学共7个教研室，药学综合实验教学中心、中药标本室及药物分子设计与新制剂校级重点实验室共3个实验室。
药学系拥有一支专业知识扎实、梯队结构合理的师资队伍。现有专任教师49人，硕士学位以上教师比例为94%，高级职称比例为53%，其中山西省教学名师1人，山西省 131领军人才 1人，入选 三晋英才 计划拔尖骨干人才1人，山西省模范教师1人，山西省 1331工程 立德树人建设计划高校教书育人好老师1人。现已形成心血管药理、抗肿瘤药理、靶向药物设计、药物递送系统等几个稳定的研究方向，近五年获批各级各类项目40余项，授权专利5项，发表科研论文百余篇，其中SCI收录50余篇，获山西省第十九届优秀学术论文奖二等奖1项，三等奖2项，获国家级教学成果二等奖1项、山西省教学成果特等奖1项、一等奖3项。
药学专业学生在全国第一届医药院校药学/中药学世界大学生创新创业暨实验教学改革大赛获二等奖1项、三等奖1项； 互联网+ 创新创业大赛 、 创青春 山西省第十五届兴晋挑战杯大学生创业大赛获三等奖2项。考取研究生院校分布在中国药科大学、沈阳药科大学、吉林大学、郑州大学、苏州大学、四川大学、重庆医科大学、西安交通大学、哈尔滨医科大学、浙江中医药大学、军事医学科学院毒物药物研究所等国内一流院校。近五年来药学系获批各级大学生创新创业训练计划项目12项，发表论文10余篇。
药学系全体师生坚持以 立德树人 为根本任务，坚持秉承 厚德精业、济世报国 的校训精神， 笃学慎思，敬业品正 的教风和 勤学善思，知行合一 的学风，以为人类健康，培养面向基层的医药融会贯通的高素质应用型人才为使命，在传承医药文化的道路上不断奋进。
