马克思主义学院成立于2015年4月，其前身为 两课 教学部、政法与经济管理系（思想政治理论教学部）。马克思主义学院现在是甘肃民族师范学院马克思主义理论和思想政治教育教学的重要基地，在坚持 注重基础性、加强实践性、突出师范性、倡导创新性、发展综合性 工作思路的引领下，通过以培养方案为依据，以教学改革为核心，以精品课程和重点课程建设为突破口，树立 服务地方，特色发展 的教学理念和积极促进民族地区和谐稳定、专业建设与地方发展的实际需要相结合的办学定位。
学院目前设有思想政治教育专业（有普通方向、藏汉双语方向和民族团结教育三个方向）。2011年思想政治教育专业民族团结教育方向被列为甘肃省高等学校 特色专业建设点 ，2019年思想政治教育专业入选省级一流专业（目前正在积极申报国家级一流本科专业），同年，我院被教育厅列为甘肃省第二批省级重点马克思主义学院培育单位，办学成就得到了省级教育行政主管部门的肯定。学院设有五个公共思政教研室和一个专业思想政治教育教研室。学院现有专兼职教师42人，其中教授6人，副教授12人。硕士及以上学历的教师占全院教师总数的84%以上。学院现已建有腊子口等四个爱国主义教育基地。学院重视学科建设，目前学院已建成《形势与政策》、《中国近现代史纲要》等省级精品课程两门；建成《马克思主义基本原理概论》、《中国近现代史纲要》、《毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论》和《形势与政策》等省级 精彩一课 四门。已建成《思想道德修养与法律基础》和《中国特色社会主义理论体系》两门校级示范课。正在建设《马克思主义基本原理概论》校级示范课。
2017年12月，习近平新时代中国特色社会主义思想研究会在我院挂牌，整合哲学社会科学骨干教师师资，充分发挥研究会宣讲、诠释、研究和传播的四大功能作用。
马克思主义学院于2018年7月16日至19日，成功承办了全国高校马克思主义理论学科研究会第37次学科论暨甘肃省哲学学会2018年年会并编纂文集，扩大了我校的办学影响力。2021年，我校与西北民族大学签订联合共建马克思主义学院合作协议，为我校进一步建强建好马克思主义学院，不断提升马克思主义学院建设的科学化、规范化、现代化水平，提供了经验与帮助。
2019年，我院入选为甘肃省第二批重点马院培育单位。2020年我院成功入选甘肃省第二批思想政治理论课名师工作室（甘肃省思想政治理论课马文清名师工作室），充分发挥工作室的辐射带动作用，促进甘南州大中小学思想政治理论课一体化建设。新时期，学院正以更高的标准加强学科、课程和队伍建设，进一步突出特色，不断实现新的跨越。
