为服务国家创新驱动发展战略和《中国制造2025》,推进国家、区域经济社会发展和产业转型升级，培养造就更多高层次工程科技人才，在教育部和浙江省委省政府的正确领导下，浙江大学于2015年7月开始筹备浙江工程师学院（浙江大学工程师学院）。该项目也得到了杭州市委市政府和拱墅区委区政府的大力支持。学院于2016年9月12日正式揭牌成立。
工程师学院定位为高层次工程科技人才复合交叉培养的特色学院，主要开展研究生层次工程师培养和企业工程师培训。学院紧密依托浙江大学高水平的综合办学优势，坚持 校企协同、复合交叉、国际合作 ，努力打造成为支撑我国经济社会发展和产业转型的高层次工程科技人才培养基地和工程领域的产学研创新平台。
学院积极推进工程专业学位研究生教育改革，按照 高层次、高素质、国际化 的人才培养理念，探索应用型、复合型、创新性的工程科技人才培养体系。服务国家重大需求，学院重点开展面向企业、复合交叉的专业学位研究生卓越培养项目，精心打造一支专兼结合的高水平工程教育创新师资队伍，着重加强研究生技术应用创新和工程专业实践训练，大力建设具有一流水平的工程创新与实训平台，积极推动科教协同、产教融合的培养模式创新，切实开展与法国巴黎综合理工学院、荷兰埃因霍温理工大学等世界高水平工程院校多种形式的国际联培项目合作。
2020年，学院招收研究生1469人，其中工程博士研究生159人。9月新生入学后，在校研究生逾4000人，其中工程博士近400人。
