昆明市中医医院始建于1956年，是一所集医疗、教学、科研、防保、康复、社区医疗等综合服务能力为一体的 三级甲等中医医院 、云南中医学院第三附属医院、云南省中医名院、云南陆军预备役师医院、国家中医药管理局中医药优势学科（中医外科肛肠病学）继续教育基地、国家中医药管理局社区中医药知识与技能培训示范基地，国家中医药管理局农村中医药知识与技能培训示范基地，云南省中医药全科医师培训基地，云南省中医住院医师规范化培训基地，云南省中医药骨干医师培训基地，昆明市中医药制剂中心。曾荣获 全国卫生系统先进集体 、 云南省中医药工作先进集体 称号。
医院现有三个执业点（东风东路院区、关上院区、呈贡院区），总占地面积：160亩，总建筑面积：16.5万平方米，编制床位1700张。设有23个临床科室，11个医技科室，20个行政职能科室，1个社区卫生服务站。现有在岗职工1318人，其中高职149人，硕士研究生导师58名，博士生导师3名，博士、硕士研究生223名。昆明市中医医院呈贡医院投资8.86亿，占地面积124亩，总建筑面积12.9万平方米，编制病床1000张，2015年7月6日投入使用，目前开设病床737张。医院设施设备齐全，拥有1.5T磁共振、64排螺旋CT、多普勒彩色超声、全自动生化仪、钼靶等大型医疗设备，临床普通设施及常规设备可有效满足各项业务需求。
医院一直把中医特色专科专病建设作为事业发展的主线来抓，逐渐形成一批优势学科，现拥有国家、省、市级重点专科专病41个，云南省区域中医诊疗中心2个（云南省骨伤区域中医诊疗中心、云南省肛肠区域中医诊疗中心），云南省中医药临床重点学科2个（中医骨伤学、中医肺病学）。省级内设研究中心3个，市级内设研究机构（研究中心、技术中心）27个，昆明市科技创新团队4个。拥有全国中医学术流派传承工作室1个，云南省中医学术流派传承工作室2个，国家级、省级名医工作室8个，昆明市名中医工作室7个，呈贡区名医工作室3个，肺病科为 2012年国家临床重点专科（中医专业） ，骨伤科为国家中医药管理局 十一五 重点专科，针灸科、肺病科、重症医学科为国家中医药管理局 十二五 重点专科； 治未病 中心为国家中医药管理局 2013年中医药预防保健及康复临床服务能力建设单位 。
医院历来重视中医药继承工作，有着悠久的中医药传承的光辉历史和影响力，中医文化底蕴深厚，名医名家荟萃。医院建立了四级中医药学术传承工作体系，有国家、省市级名老中医师承指导老师18名，享受国务院政府特殊津贴专业技术人员4名，云南省有突出贡献的优秀专业技术人员4名，昆明市有突出贡献的专业技术人员10名，享受省政府特殊津贴6人，全国优秀中医临床研修人才5名，省、市荣誉名中医及名中医53名，获省市级学术和技术带头人及后备人选、昆明市卫计委 十百千 工程培养共123人次。
昆明市中医药制剂中心设备先进，管理规范，符合《医疗机构制剂配制质量管理规范》（GPP）要求，具备生产蜜丸、水叠丸、散剂、片剂等21种剂型的能力，列入医保用药目录的院内特色制剂78种。
面对新的机遇和挑战，医院将遵循中医药自身的发展规律，坚持继承与创新，坚持 特色立院、专科强院、创新兴院、开放活院、环境优院 的发展战略，秉承 究医术之精，谋大医之德 的医院文化精神，科学管理，务实创新，实现医院又好又快的全面发展，为人类健康、社会进步做出新的更大的贡献。
