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复旦大学附属儿科医院系国家儿童医学中心依托单位，是集医、教、研、防为一体的综合性儿童专科医院。全国儿科学重点学科、国家 211工程 和 985 工程建设单位。是国家首批儿科学硕士、博士学位授权点和首批临床医学博士后流动站。医院经过68年的发展，学科综合实力领先，专科临床诊治特色突出，目前共设50个临床专业医技科室，拥有一大批国家级和省部级重点学科。拥有包括新生儿、重症医学科、小儿消化科、中医儿科、小儿外科、临床护理等7个国家临床重点专科。在中国医学科学院发布的中国医院科技竞争力排行榜、复旦大学发布的中国医院最佳专科声誉排行榜和北京大学发布的中国医院最佳临床学科排行榜，我院儿科学均位居前列。

二、儿科研究院

中国儿童健康与疾病临床转化研究和精准医疗最主要的 孵育基地 。研究院拥有建筑面积16000平方米的研究大楼。

儿科研究院成立于1979年，是医院的科研实验平台和研究生培养的基地，主要承担支撑学科、转化研究和服务临床的重要任务，为科研项目的开展提供实验技术支撑和服务，为研究生实验研究能力的培养提供指导和帮助。

研究院拥有卫健委新生儿疾病重点实验室、上海市出生缺陷防治重点实验室、复旦大学儿童发育与疾病转化医学中心和复旦大学生殖发育研究院（儿科分部），并设有分子医学中心、公共实验平台、病原学实验室、临床信息生物样本库、斑马鱼平台、小鼠动物平台、干细胞平台以及临床流行病学研究室、临床指南制作与评价中心、儿童健康与政策研究中心。目前，研究院已经拥有一支梯队层次合理，团结奋进，朝气蓬勃，极富创新能力的科研团队。