香港大学深圳医院是由深圳市政府全额投资，并引进香港大学现代化管理模式的大型综合性公立医院,是推进深圳市公立医院改革的试点单位。医院总投资约40亿元，占地面积19.2万平米，总建筑面积36.7万平米。
医院于2012年7月开业，现有床位2000张，可容纳门诊量8000至10000人次/日，目前已通过三甲医院评审，随着医院二期扩建，至2020年底，病床更将增至3000张，极大地缓解就医难问题，医院也将努力建设成为一家 国内一流、国际知名 的集医、教、研于一体的现代化、数字化、三级甲等综合医院。医院在推进内地公立医院法人治理、人事制度改革和医疗价格改革，以及诊疗服务模式创新、医务人员职业荣誉感提升等方面开创了先河、树立了典范，倡导廉洁行医文化和 暴力零容忍 理念在全国亦引起广泛关注，有力促进了医患关系和谐。
开业至今，医院逐步引进国际一流的先进医院管理经验和医疗技术，通过改革创新和资源互补，为市民提供优质医疗服务。医院借助国际化的诊疗模式和香港专家的技术力量，按照 大专科、小综合 的发展思路，已开设20个诊疗中心、12个医技中心，并逐步引进香港大学肿瘤综合治疗、生殖医学及产前诊断、骨科与创伤、心血管、器官移植等五大优势医疗专科。同时，为满足市民及外籍人士对多元化医疗服务的需求，医院亦设立了国际医疗中心，提供具有国际先进水平，注重人文关怀的国际化高端医疗保健服务。
2015年9月，医院已通过澳大利亚医疗服务标准委员会（ACHS）全机构认证，成为内地首家获得ACHS认证的医院。
2017年10月28日，医院已通过国家三级甲等综合医院现场评审。
2017年11月22日，省卫计委确定香港大学深圳医院为三级甲等综合医院。
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