衢州市第三医院创建于1989年，是以精神卫生、康复医疗为特色，集医疗、科研、康复、司法鉴定和防治职能于一体的三级乙等精神专科医院，2014年1月增设第二名称衢州市老年康复医院。现为衢州市精神卫生中心、心理咨询与治疗中心、老年医学中心、康复医疗中心和衢州市社区戒毒治疗定点医院，同时也是衢州学院、衢州职业技术学院的教学医院。
医院占地面积42.5亩，建筑面积5.59万平米，在建的精神疾病伴发传染病隔离病区项目建筑面积2万平米。医院核定床位600张，实际开放床位690张。设有15个临床病区及1个司法鉴定所，10余个辅助检查科室。医院还全权运营衢州市康复医疗中心。
医院现有职工500余人。其中，医护技专业人员400余人，高级职称60余人，中级职称140余人，省医坛新秀3人，市级名医8人，市115人才9人，硕士（研究生）20余人。
医院不断加强对外交流合作，促进医院可持续发展。2016年9月组建了衢州市第三医院医疗集团，与上海华山医院、浙江省立同德医院、浙大邵逸夫医院、中南大学精神卫生研究所、武汉精神卫生中心、杭州市第七人民医院（浙大医学院精卫中心）等医疗机构建立长期的协作关系，并加入了国家精神心理疾病临床医学研究中心联盟单位、浙江老年病专科联盟等十余个医联体。
精神科和老年医学科为衢州市市级重点学科，心理科和老年精神科为衢州市首批特色专科。医院在进一步做强、做精普通精神科的基础上，近年来不断加强亚专科建设，形成了以老年精神科、临床心理科、睡眠障碍科、儿少心理科、情感障碍科、精神康复科等为主的一批特色专科，在睡眠障碍、抑郁障碍、焦虑障碍、强迫障碍、儿童多动症、自闭症、痴呆、精神分裂症、双相情感障碍等精神疾病的诊治方面特色优势明显。医院开设特色门诊、特需门诊，聘请李凌江、赵靖平、于恩彦、陈炜等国内知名专家定期来院坐诊、查房和临床科研指导。
近五年，医院主持立项课题32项，其中厅局级7项。参与合作国家重点研发项目1项，参与合作省中医药科技计划项目1项。发表科研论文169篇，其中一级论文32篇，SCI收录4篇。举办国家级继教项目20项，省级继教项目18项。
医院不断发展互联网医疗，推进 三位一体 智慧医院建设，是衢州市最早一批通过四级电子病历测评的医院之一，目前正在积极建设五级电子病历。
近年来，医院荣获了全国文明示范街十优单位、省文明单位、省平安医院、省无烟单位、省健康促进医院、省级绿色医院、省抗击新冠肺炎疫情先进集体、全国巾帼文明岗（二病区老年精神科）、市直卫生系统先进单位、市级治安安全先进单位、市诚信优质服务示范单位等荣誉称号。
医院坚持 仁爱、精益 的院训，秉承 一切为了病人，为了病人一切 的服务理念，以 打造心灵花园，幸福家园 为愿景，努力建成四省边际中心精神专科医院。
