动物科学技术学院源于1921年北京农业专科学校创建的畜牧学科，北京农业专科学校于1923年改名为国立北京农业大学，畜牧学科改为畜牧学系；1949年由北京大学、清华大学、华北大学三校的畜牧学系合并成立北京农业大学畜牧学系；1993年在原北京农业大学畜牧学系的基础上成立动物科学技术学院。
动物科学技术学院自2015年起，由呙于明教授担任院长。现设置5个系（动物遗传育种科学系、动物繁殖与发育科学系、动物营养与饲料科学系、智能养殖与环境科学系、伴侣动物科学系）。 1个本科专业（动物科学），3个硕士、博士学位授权点（动物遗传育种与繁殖、动物营养与饲料科学、畜牧生物工程）、1个畜牧学博士后流动站，设有农业推广专业学位硕士研究生招生点。每年招收本科生120人，每年招收博士生70余人，硕士生160余人。现有在校生1066人，其中其中本科生458人，硕士研究生329人，博士研究生279人(留学生13人)。2017年，畜牧学一级学科入选 双一流 建设学科，教育部公布第四轮学科评估结果中，畜牧学科排名为A+。
学院现有教职工131人，其中专任教师99人，教辅人员14人，管理人员18人。专任教师中教授（含研究员）46人，副教授（含副研究员）47人，讲师6人。中国科学院院士1人，中国工程院院士2人，国家杰出青年基金获得者6人，国家优秀青年科学基金获得者2人，教育部新世纪优秀人才支持计划16人，农业部现代农业产业技术体系首席科学家5人、岗位科学家18人。
学院拥有省部级及以上科研基地19个，其中国家级重点实验室2个：动物营养学国家重点实验室和畜禽育种国家工程实验室；国家级中心2个：国家饲料工程技术研究中心和国家家禽测定中心，部级重点开放实验室4个：农业部动物遗传育种学科群综合实验室、农业部饲料安全与生物学效价专业实验室、北京市畜禽遗传改良和北京市生物饲料添加剂，部级研究中心8个：农业部饲料工业中心、农业部饲料效价与安全监督检验测试中心（北京）、农业部家禽品质监督检验测试中心、全国种猪遗传评估中心、农业部饲料质量安全监督检验中心、中法肉牛研究与发展中心、北京市生鲜乳质量安全工程技术研究中心和中荷奶业发展研究中；国家农业产业技术研发中心 5个：国家蛋鸡产业技术研发中心、国家奶牛产业技术研发中心、国家肉牛产业技术研发中心、国家兔产业技术研发中心和国家牧草产业技术研发中心；实验与实践教学中心1个；国家级产业技术联盟 1个。拥有实验与实践教学中心1个，农科教合作人才培养基地3个。 学生实习基地20个。还有1个国家一级学（协）会秘书处（中国马业协会），8个二级学会秘书处（世界家禽学会中国分会、动物遗传育种学分会、动物数量遗传学会、动物营养学分会、养牛学分会、养猪学分会、动物繁殖学分会、）挂靠本院。
