西安交通大学马克思主义学院成立于2009年，2015年4月独立设置。2017年3月，西安交通大学马克思主义学院入选第二批全国重点马克思主义学院。
2015年11月西安交通大学与陕西省委宣传部正式签约共建马克思主义学院，根据共建框架协议，中共陕西省委宣传部将在政策、经费等方面大力支持西安交通大学马克思主义学院建设，努力把西安交大马克思主义学院建成马克思主义理论教育、理论宣传、学科研究和人才培养的西部重镇和全国示范性重点马克思主义学院，在西部地区高校发挥马克思主义理论教育、研究宣传和人才培养带动作用。
学院师资力量雄厚，人才济济。现有正式教职工75人，专职教师70人，其中教授17人，副教授27人。教师中有多人获得国家和陕西省以及学校各类荣誉称号。
为了促进学校思想政治理论课教师队伍与大学生辅导员队伍的深度融合，进一步增强思想政治理论课教学研究实效性和水平，学校于2015年5月成立 大学生思想教育与实践研究中心 ，将学校全体本硕博辅导员纳入马克思主义学院兼职师资队伍，进一步扩大了思想政治理论教学研究团队和师资力量。
学院实施本硕博贯通培养模式，除设有马克思主义理论一级学科博士点和马克思主义理论博士后流动工作站外。学院还于2015年开始恢复设置思想政治教育（马克思主义理论方向）本科专业。学院还另设有中共党史和马克思主义政治经济学两个二级学科硕士点。
学院设有 马克思主义原理研究所 、 中国马克思主义研究所 、 思想政治教育研究所 、 近现代历史研究所 、 马克思主义与社会发展研究所 、 国外马克思主义研究所 六个二级教学单位，具体负责承担马克思主义理论六个二级学科及相关学科的人才培养与建设、以及全校本硕博思想政治理论课的教学和研究工作。
学院设有 陕西高校德育研究中心 和 陕西大学生形势与政策教育信息中心 两个省级教学科研基地，拥有 中国特色社会主义理论研究中心 陕西省重点研究基地和 马克思主义中国化研究协同创新中心 。此外，学院还设有10个特色研究中心，具体组织开展相关领域学术研究、社会服务及政策咨询工作。
2015年11月为深入研究宣传党的十八以来马克思主义中国化的最新理论发展，打造以研究马克思主义中国最新理论成果为核心的研究基地和重点服务陕西经济社会发展的新型智库，在中国陕西省委宣传部的指导下，西安交通大学与陕西省委政策研究室、陕西省委党校、陕西省人民政府研究室、陕西省社会科学院、陕西省社会科学界联合会，本着战略合作、优势互补、联合攻关的原则，经过共同协商，决定共建 马克思主义中国化研究协同创新中心 ，在科学研究、教育教学、人员培训、政策咨询等方面开展全面合作。
